近年来，在加快转变经济增长方式、促进“三新”产业发展中，连云港经济技术开发区紧紧依靠自主创新，加快推进产业升级，科技产业的产出率占到全区工业增加值的48%。去年4月以来，开发区仅用一年的时间，就已研制开发新产品新技术156个，获得国家授权专利100个，其中有43个专利技术已初步实现了产业化。
创新是企业发展的核心力量，为扶持和壮大优势产业，连云港市开发区不断加大政策扶持力度，加快自主创新步伐。开发区管委会在已开辟科技孵化器创业园2600亩的基础上，又新批创业用地3000亩，同时出台了《加快新能源发展鼓励办法》、《科技领军人才创新奖励办法》等一系列政策规定，鼓励和吸纳人才，对创新创优企业给予政策扶持。目前，开发区财政已累计支付扶持创新创业资金5亿多元，用于支持自主创新企业的发展，实施科技创新重奖政策和“三新”产业“扶优扶强”计划及产业技术创新计划。
现在，新能源、新材料、新医药等“三新型”优势科技产业，已成为连云港市开发区面向海内外吸纳产业集聚的品牌。近年来，前来开发区投资的62个“三新”项目，大都集中在新药组合物、光学仪器、风力机叶片、风力发电机及其配套设备、太阳能、光电等方面，均为科技含量高、资源消耗少、投资强度大和产业关联度高的科技研发制造企业。法国罗盖特公司在开发区发展几年来，已三次追加投资累计达4.99亿美元，用于节能减排、革新更新工艺技术和扩大生产规模。中金玛泰引进日资千万美元，加快泡罩包装覆盖膜的研制，其4项专利获得了江苏省第五届专利优秀奖。恒瑞、康缘、华威、光辉、天诺等一批标志性企业，也纷纷追加投资，添置仪器设备，增加人员和课题，扩大生产规模。
产业资本的聚集效应也带动了连云港开发区骨干企业承担的9个国家863计划、14个江苏省科技攻关项目和国家130余项火炬计划项目等科技产业化计划的研制与开发进程。截至目前，开发区已开发完成国家级技术攻关项目29个，高新技术产品92个，且全部通过了国家技术认定，拿到了专利证书或新产品证书，其中有27个新产品被评为国家和江苏省优秀名牌产品。
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