近年来，启东在实施知识产权战略过程中，突出自主创新，把自主创新作为战略基点，通过建立企业为主体、市场为导向、产学研结合的技术创新体系，使企业的专利意识明显增强，申请专利的积极性显著提高，专利申请量快速递增，企业自主创新能力明显增强。从2005年的年专利申请量344件到2007年的年专利申请量877件，专利授权也从2005年的114件到2007年为547件，分别翻了一番多。
目前，该市有123家企业拥有职务发明专利，其实施在90﹪以上，其中有295个专利产品实现了产业化，专利产业化年产值达60多亿元。近三年来，在全市高新技术企业中的专利产品有110个被列入省以上各类科技计划项目，其中国家中小企业创新基金项目4个，国家重点新产品计划项目14个，国家火炬、星火计划项目27个，省攻关计划项目10个，省重大科技成果转化资金项目5个，共有49个产品被认定为省高新技术产品。全市通过南通市级以上科技成果鉴定的具有自主知识产权的项目73项，产业化实施率达100﹪，累计实施销售收入56亿元。在专利产品中，获省科技进步三等奖以上有4个，南通市科技进步一等奖5个，有2个专利获省优秀专利奖。呈现出提高自主创新能力与拥有更多的自主知识产权，两者相辅相成、相互依存、互相作用的一体化发展
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